1982-1991 yılları arasında, çeşitli muhabere birliklerinde takım ve bölük komutanlığı görevlerinde bulunan Orgeneral Bayraktaroğlu, 1993 yılında Kara Harp Akademisi’nden, 1997 yılında Silahlı Kuvvetler Akademisi’nden mezun olmuştur.
Kurmay subay olarak, 1993-2009 yılları arasında muhtelif kıta ve karargâh görevlerini icra etmiş; 2009 yılında Tuğgeneralliğe terfi etmiştir.
Tuğgeneral rütbesiyle; 2009-2011 yılları arasında 9. Komando Tugay Komutanlığı, 2011-2013 yılları arasında Kara Kuvvetleri Lojistik Komutanlığı’nda Mühimmat Komutanlığı görevlerini yürütmüş ve 2013 yılında Tümgeneralliğe terfi etmiştir.
Tümgeneral rütbesiyle; 2013-2014 yıllarında Genelkurmay MEBS ve Siber Savunma Komutanlığı, 2014-2016 yılları arasında ise 3. Ordu Kurmay Başkanlığı görevlerinde bulunmuş ve 2016 yılında Korgeneralliğe terfi etmiştir.
Korgeneral rütbesiyle; 2016-2020 yılları arasında Genelkurmay Personel Başkanlığı görevini icra etmiş; 9 Ocak 2020 itibarıyla Genelkurmay II. Başkanlığı görevini üstlenmiş; 2021 Yılı Yüksek Askerî Şûra Kararları ile Orgeneral rütbesine terfi etmiştir.
Orgeneral Bayraktaroğlu, 3 Ağustos 2023 tarihinde onaylanan Cumhurbaşkanlığı Kararnamesi ile Kara Kuvvetleri Komutanlığı görevine atanmıştır.
Bayan Hürriyet Bayraktaroğlu ile evli olan Orgeneral Bayraktaroğlu, iki çocuk babasıdır.
